拥有超能力的日本高中生，因为一次偶然的机会在街头遇到了一个正在执行神秘任务的少女。在一系列的机缘巧合之下，同时也是为了维护人类和神界的和平，两位少年和他们的伙伴们踏上了漫长的征程。

崭新系列的开始！瀞霊挺的人们各自都过着平稳安逸的日子。可就在这时，白哉、恋次、日番谷、乱菊、雏森、吉良、一角、弓亲、露琪亚等所有死神都收到了紧急召集的命令。那是因为在不可思议的事态前，显得不知所措的死神面前出现了一个叫村正的妖男。他以把所有斩魂刀都实体化作为宣战布告，失去唯一武器的死神们遭到人形化斩魂刀无情地袭击。斩魂刀与死神们的新战役即将打响。

死神第一个篇章：尸魂界拯救篇，男主角黑崎一护是个看似暴力、单薄，实质上善良、勇敢、爱护家庭的少年，并且拥有能看见灵的体质。家里有一个开诊所的老爸和两个性格正常的妹妹夏梨和游子，一护每天七点必须按时回家，否则老爸便会使用“身体语言教训”的家规教训一护。吵闹的父子，懂事的妹妹以及与其他普通人并无大异的普通生活，直到女死神朽木露琪亚被他一脚踢到墙角并满脸惊疑地望着他问“你能看见我？”时序幕才这样被正式地揭开。 从此黑崎一护身边所有的事物都产生了翻天覆地的变化。

经历漫长的战争之后以七代目火影漩涡鸣人治理的木叶村为中心，成立了新的忍者5大国，本作主要讲述鸣人的儿子、虽然有才能却把鸣人叫做臭老爸的漩涡博人；佐助的女儿、对鸣人抱持憧憬的宇智波佐良娜；以及充满了谜团的超级优秀忍者巳月三人一组，在村子里努力修炼成长的故事。